光緒十年(1884年)，知縣彭君谷重修，有大雄寶殿、漢白玉石，七級浮屠塔、藏經書的圭峰閣、千手堂、玉虛閣、文昌宮、真人庵、玉虛宮、天帝廟、諸天廟、水月宮、石筍廟、瓊華洞、漱玉池、觀山亭等建筑，是廣東著名叢林之一。每年八月二十四日，鄰縣僧尼都來這里受戒。民國二十八年(1939年)四月，會城淪陷，日軍將寺拆毀。抗戰(zhàn)勝利後，一些熱心人士在玉臺寺廢墟上蓋搭簡陋的屋舍，後又荒廢。